Fujifilm GFX 50S II là một chiếc máy ảnh medium format nhỏ gọn với cảm biến 51MP (44x33mm) sử dụng ngàm GF. Máy được trang bị hệ thống chống rung trong thân (IBIS) với hiệu suất lên đến 6.5 stop, giúp giảm thiểu rung lắc khi chụp.
Người dùng có thể ngắm chụp qua màn hình cảm ứng 3.2 inch với cơ chế lật hai trục hoặc qua kính ngắm điện tử (EVF) lớn, độ phân giải cao. Hệ thống lấy nét được nâng cấp với khả năng nhận diện khuôn mặt và mắt chính xác hơn, dù vẫn sử dụng lấy nét theo tương phản.
GFX 50S II có màn hình OLED hiển thị thông tin trên đỉnh máy và hỗ trợ tùy chỉnh linh hoạt. Ngoài ra, máy có thể tạo ảnh 205MP bằng cách dịch chuyển cảm biến, giúp giảm hiện tượng sai màu. Thân máy được thiết kế chống chịu thời tiết, phù hợp để sử dụng trong nhiều điều kiện khắc nghiệt.